Pacbio做为三代测序的先驱,SMRT技术为我们提供了科研的更多可能。在三代转录组测序,只有clontech一个品牌为PacBio提供配套的试剂盒。Tiosbio的出现为科研领域增加了选择。Tiosbio根据PacBio的技术特点。进行了大量的优化和改进。使整个操作程序由原来的2天时间缩短到8个小时以内。Tiosbio推出了SUPERSWITCH®
三代转录组建库试剂盒。SUPERSWITCH™第三代测序转录组文库构建试剂盒提供了一种基于PCR方式从纳克级总RNA合成高质量cDNA的方法。SUPERSWITCH™第三代测序转录组文库构建试剂盒cDNA合成技术是基于RNA转录5’末端跳转机制 (Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template,SMART) 技术。SMART技术非常适合起始样品量有限的材料,能够以2 ng总RNA(或极低浓度样本)合成的高质量cDNA,用于杂交探针、”Virtual Northern” blots、cDNA测序及其他应用。
试剂盒组分:
目的 |
试剂 |
PacBio |
Nanopore |
||||
SP0021 |
SN0021 |
||||||
M/10次 |
L/20次 |
M/10次 |
L/20次 |
||||
反 转 录 |
1 | ●SUPERSWITCH™ 3RRT Oligonucleotide |
12μL |
24 μL |
6μL |
12μL |
|
2 | ●dNTP Mix (10 mM) |
40 μL |
80 μL |
20 μL |
40 μL |
||
3 | ●Deionized H2O |
100 μL |
100 μL |
100 μL |
100 μL |
||
4 | ●5X First-Strand Buffer (RNase-Free) |
60 μL |
120 μL |
30 μL |
60 μL |
||
5 | ●SUPERSWITCH™ SolutionⅠ |
10 μL |
20 μL |
5 μL |
10 μL |
||
6 | ●SUPERSWITCH™ SolutionⅡ |
10 μL |
20 μL |
5 μL |
10 μL |
||
7 | ●RNase Inhibitor (40 U/μL) |
12 μL |
25 μL |
6 μL |
12 μL |
||
8 | ●SUPERSWITCH™ Reverse Transcriptase (200 U/μL) |
12 μL |
25 μL |
6 μL |
12 μL |
||
9 | ●SUPERSWITCH™ 5RRT Oligonucleotide |
12 μL |
24 μL |
6 μL |
12 μL |
||
PCR | 10 | ●5AP PCR Primer (12 μM) |
100 μL |
200 μL |
100 μL |
200 μL |
|
11 | ●3AP PCR Primer (12 μM) |
100 μL |
200 μL |
100 μL |
200 μL |
||
12 | ●Marathon DNA Polymerase(1U/μL) |
24μL |
48μL |
24 μL |
48 μL |
||
13 | ●2×PCR Buffer |
765μL |
1530 μL |
765μL |
1530 μL |
||
14 | ●2.5 mM dNTP |
160μL |
320 μL |
200 μL |
400 μL |
目的 |
试剂 |
PacBio |
Nanopore |
|||
M/30次 |
L/60次 |
M/30次 |
L/60次 |
|||
PCR 产物 纯化 |
1 | ○Buffer P5 |
7.5 mL |
15 mL |
15 mL |
30 mL |
2 | ○Wash Buffer |
3.25 mL |
6.5 mL |
6.5 mL |
13 mL |