本试剂盒采用重组酶介导等温核酸扩增(Recombinase Aided Amplification,RAA)技术对检测目标序列进行扩增。在等温条件下(通常为39℃),RAA体系内的重组酶和引物形成蛋白/单链核苷酸的复合体 Rec/ssDNA,在辅助蛋白和单链结合蛋白 SSB 的帮助下,侵入双链DNA 模板;在侵入位点形成 D-loop 区域,并开始对 DNA 双链进行扫描;待找到与引物互补的目的区域后,复合体 Rec/ssDNA 解体的同时,聚合酶也结合到引物的 3′ 末端,以样品DNA为模板,12 ~ 20 min即可实现对目的基因片段的高效扩增。扩增体系含有正、反向扩增引物和特异性的分子探针。在 39 ºC 下,特殊修饰的探针经过exo 酶的切割后,可使用荧光监测设备对目标片段扩增过程进行实时监控。适用于各种品牌的荧光定量 PCR 仪、恒温荧光扩增仪器等荧光检测设备。
正、反向引物建议的设计长度为30 ~ 35 nt之间,长度通常长于PCR引物。引物过短可能会降低反应重组率,响扩增速度和检测灵敏度;引物过长则有可能形成二级结构而影响扩增。引物浓度应根据模板的浓度进行筛选,以确定最佳浓度,提升扩增效率。扩增片段的长度推荐为150 ~ 300 bp,通常不超过 500 bp。注意,模板DNA片段过长或出现重复序列时,扩增的准确性会降低。
在正、反向引物中间,设计一段长度为 46 ~ 52 nt 与目的片段互补的探针序列。探针序列避免回文序列、内部二级结构和连续的重复碱基。探针序列共有四个修饰位点:距离 5’端的≥35 nt 的中部位置标记一个dSpacer(四氢呋喃,THF),作为核酸外切酶的识别位点;THF 位点的上游标记一个荧光基团,下游标记一个粹灭基团,两个基团的间距为 2 ~ 4 nt;THF 距离 3’末端≥15 nt,并且 3’末端标记一个修饰基团,例如胺基、磷酸基团或 C3-Spacer。
预期用途:
本试剂盒仅供科研使用,适用于各种DNA模板的扩增,核酸扩增产物可使用进行检测。
包装规格:48次,货号JY0204。
RAA核酸扩增试剂盒的储存条件:-20℃避光保存,有效期14个月,避免重压和反复冻融。反应单元开封后,须当天用完。
检测灵敏度:
本试剂盒检测极限约为1×101拷贝/反应(试剂盒的检测灵敏度与目的序列的GC含量及引物的扩增效率有关)。